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Nature:精准药物开发面对哪些实在的窘境?

出处:bob体育平台网页版发布日期:2021-12-04 23:50:28 浏览次数:1

  《天然》(Nature)杂志英文版日前宣布文章称,要想把靶向疗法用于更多患者,需求将基因组数据与临床数据相整合,让这些信息可以被广泛接入。

  10个月前,来自新泽西的一位76岁尿道癌晚期患者的医师们决议为她测验一种非传统疗法。几周前,他们把这位患者的肿瘤样本发给威尔康奈尔医学院(Weill Cornell Medical College)精准药物(Precision Medicine)研讨所。基因测序数据显现,她具有比正常人更多的HER2基因副本。

  通过多年的手术、化学疗法和放射疗法医治失利后,医师们决议在医治计划中参加赫赛汀(Herceptin,注射用曲妥珠单抗)。赫赛汀一般用于医治搬运性乳腺癌,但它是针对HER2变异来处理问题。服药后,这位患者的病况明显改进。

  基因测序技能极大地进步了发现导致肿瘤恶化的基因变异的可能性,但一起,由此而发生的海量基因数据又很少被运用,由于它们并未与临床数据相整合,如宗族病史。此外,当时的基因组数据一般以文档方式存在,不简略被查找、同享,并且许多医师都读不明白。

  用于癌症医治的精准药物要想到达美国总统奥巴马(Barack Obama)和其他人所预期的成功水平,这些基因测序数据有必要实时地与患者相衔接。咱们需求将基因组数据和临床数据相整合,以易于查找的方式提供给医疗和研讨人员。”中心数据银行”的原型正展示出其极大潜力,但这需求进行持续地出资。

  临床医师现已习惯于评价来自于惯例化验成果中的20~50项健康目标,如血糖水相等。这些数据很简略被整合到患者的电子健康记载中,但基因组数据远比这杂乱得多。

  为便于了解基因组数据的规划,咱们以始于2005年的对致癌骤变进行分类的美国”癌症基因组阿特拉斯”(The Cancer Genome Atlas)项目为例,将2.5PB(1PB等于1000TB)的数据从一台核算机服务器搬运到另一台需求25天的时刻。

  极端杂乱的基因组数据陈述很少以电子方式存在,也很少与患者的基本信息相关联。世界癌症基因组协会(ICGC)对近14000位患者的肿瘤样本进行了全基因组检测,发现了近在全基因组范围内的约1300万基因变异。但除了基因变异,还有其他很多要素影响着一位患者是否合适承受某种医治计划。但惋惜的是,在ICGC项目中,或许多其他相似项目,只具有极少量的临床数据,如肿瘤的类型和尺度等。

  2013年,威尔康奈尔医学院和特伦托大学(University of Trento)归纳生物学中心的核算生物学家们启动了一个实验项目,研讨将基因组数据与临床数据实时衔接的可行性。到现在为止,咱们现已为250位患者创立了易于阅览的陈述。

  每份陈述都带有一个条形码,答应患者依据需求去除个人身份信息或从头增加个人身份信息,这些数据能轻松整合到威尔康奈尔医学中心的电子健康记载系统中。数据包括临床数据(宗族病史和药物运用等),和基因变异信息等。咱们发现,90%多的患者带有一种基因变异,可以对一种已知药物做出呼应,只要不到10%的患者合适参加临床实验。

  要拓宽其实用性,这些数据需求在职业组织内同享。以当时查询抗癌药物Neratinib的有效性和安全性(针对HER2或EGFR3基因变异所导致的肿瘤恶化患者)为例,除了肺癌患者,这些基因变异的频率在1%~6%之间,这意味着要获得II期临床实验所需求的患者数量,就需求从多个医学中心征募。在各组织之间同享数据可以极大地处理相似的临床征募问题。而当时,要处理该问题首要通过口口相传,这是个缓慢的进程。

  可是,要完结这种数据同享水平也不是一件简略的工作。在美国,许多电子健康记载系统并不兼容,在各组织之间搬运患者记载是一件适当困难的工作。

  现在,现已有一些尽力企图来处理该问题,创立数字医疗数据规范。以非营利性组织纽约市临床数据研讨网络(NYC-CDRN)为例,该组织将22家业界组织集合在一起,一起书写和办理临床数据。

  16个月后,NYC-CDRN已创立了600多万份文档,包括数十万个数据点,从简略的血钙水平到磁共振成像扫描成果。其最终目标是在数据库中整合基因数据。关于私有医疗保险系统的国家,这种中心化、用于同享、可查找的患者数据库尤为重要。

  通过精准药物医治癌症的远景现已很明亮。例如,针对BRAF(V600E)骤变(存在于60%的黑色素肿瘤患者)和IDH1或IDH2骤变(存在于80%的脑瘤患者)的靶向药物现已被同意,或正在进行5期或6期临床实验,尽管像大多数靶向医治相同,抗药性仍是一个很大的问题。在法国多个研讨组织进行的一项大规划的精准药物临床实验中,在所征募的708位患者中,现已有141位患者与靶向医治相匹配。

  与此一起,这种”精准”疗法也引发了一些问题。关于患者的更多信息被包括在中心数据库中(这一点对精准药物的长时刻成功至关重要),但要保证这些信息的”匿名化”是件困难的工作。关于自己的健康数据,患者具有哪些权力呢?这些数据能在世界上同享吗?由谁来办理和保护该中心数据库呢?由谁来支付相关费用呢?

  NYC-CDRN项目现已花费了700万美元,由于所搜集的信息越来越多,每年的本钱还将持续增加。当时针对癌症患者的靶向医治每年的本钱一般超越10万美元,而大部分患者的生命只被延伸几个月时刻。假如这样(仅延伸患者几个月的寿数),还有必要在持续研讨准药物吗?是不是应该规则,至少能延伸患者寿数一年的药物研讨才干得到支撑?

  让工作变得更杂乱的是,许多药物的真实价值只要在被FDA同意后才干表现出来。以Herceptin药物为例,开端被FDA同意时,它只能延伸搬运性乳腺癌患者寿数几个月时刻。但通过长时刻的运用后发现,它能进步乳腺癌前期患者长时刻生计的时机。

  现在,现已有一些组织开端对精准药物的研制做出辅导。在英国,国家健康与护理优化研讨院(NICE)对不同类型的乳腺癌基因测试数据的有效性进行了评价。2013年,NICE引荐了oncotype DX研讨项目用于临床,而其他三个项目(MammaPrint、IHC4和Mammostrat)被主张仅用于研讨意图,由于还没有满足的依据标明其有效性。

  精准医疗有许多理由让咱们等待,但真实要把它从基因数据层面变成针对癌症的靶向疗法,还需求咱们做出许多困难的决议,支付艰苦的尽力和贵重的本钱,来创立一个同享、可查找的数据库。(生物谷

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